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迅速破解新型腸出血性大腸桿菌基因密碼的深圳華大基因研究院,全院有4000人員,有多達180部基因排序機,DNA排序能力是全球之冠。(李泉攝)
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深圳華大基因研究院 解腸毒疫情主力成員
* c& o1 j6 d% C, N0 O8 n【明報專訊】新型腸出血性大腸桿菌(EHEC)在歐美各國先後爆發,在歐洲最少已造成19人死亡。今次迅速破解EHEC基因之謎的,深圳的華大基因研究院。研究院人員昨接受本報專訪時表示,他們只花了3天時間便初步完成這款新型大腸桿菌的基因排序,發現該菌至少對3種主要抗生素類型有抗藥性,毒性亦非常強。研究員希望在3天後研發出針對的治療措施,有效控制疫情蔓延。os.tvboxnow.com7 A) q, y9 g/ l
民營的深圳華大基因研究院曾在2003年SARS期間,成功以一星期時間迅速排列出SARS病毒基因排序,幫助開發出病毒疫苗。今次歐美12國爆發腸出血性大腸桿菌疫情,研究院再成為破譯及幫助應對這次疫情的主要成員。 S2 X! \/ ?1 i
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分析成果上載 國際共用1 ~. P8 K3 g+ A3 B
「華大基因」市場部總監楊碧澄博士透露,德國疫情爆發後,德方專家求助華大基因在歐洲的研究員,研究院在5月23日從德國漢堡大學醫學院得到大腸桿菌樣品,花了3天時間即初步完成了基因組測序和分析,該院更把成果上載到公共數據庫,讓各國研究員和機構共享成果。! P; d& Q |7 a( J0 ^: U
0 C% n0 |2 y' u; S/ Q病菌結構複雜 合用藥物少
, A5 n, ?0 f6 v& x! i w$ \% E# v1 C公仔箱論壇她透露,華大基因今次迅速成立專組,利用先進的第三代測序儀,對病菌進行測序和生物信息學分析,「團隊發現該菌株是一種新型,兼具侵襲、產毒、腸出血等特徵的大腸桿菌」。她說,該病菌結構奇怪複雜,有多種致病基因融合一起,「很多基因似乎是來自大腸桿菌,因而具有導致腸出血的能力」,治療亦比較困難。研究又發現,該菌株攜有氨基糖甙類、大環內酯類、磺胺類等抗生素的抗藥基因,由於這些抗生素都是常用於治療腸胃感染的第一線藥物,導致合用的治療藥物種類更少。tvb now,tvbnow,bttvb, j; y$ J& l% k
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正測試快速診斷試劑tvb now,tvbnow,bttvb7 T. F. k( B% R
世衛專家昨日亦表示,導致今次疫潮的大腸桿菌很罕見,過去雖然曾有在人類身上發現的個案,但從未試過爆發。楊碧澄說,目前仍未知此大腸桿菌的來源,不能排除此菌曾長期存在,只是不為人知。他們經過對比基因圖庫,發現這種大腸桿菌與2002年從非洲中部愛滋病患者腹瀉樣本中分離的腸侵襲性大腸桿菌株有96%相似,是與另一種大腸桿菌出現基因變異變成的新品種。
6 S7 P6 `7 C. w2 x; ]( s& @該院會繼續研究,通過對基因序列了解該病菌的特性,期望3天後可以找出針對診斷、監測等方案。「我們在研發快速診斷試劑,現正作測試,希望用來測出食物和病人體內是否有這種病菌。」
, p, U- b: k, E5 P( MTVBNOW 含有熱門話題,最新最快電視,軟體,遊戲,電影,動漫及日常生活及興趣交流等資訊。「研究院的合作伙伴可以通過此成果,應用到臨牀上,研製出有效的藥物和採取預防措施。希望愈快愈好。」
p$ E; S. A- h d明報記者 李泉 深圳報道
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6 h0 e s8 G y3 s【明報專訊】位於深圳的華大基因研究院,有多達180部基因排序機,論DNA排序能力是全球之冠。研究院有4000人員,單是基因排序,便有300名研究員。路透社報道,自SARS以來,中國在病毒研究上取得了迅速發展,研究院獲市政府大力支持,除收取官方撥款,該研究院還會向企業和個人提供DNA排序和其他研究服務,賺到的錢會用於研究發展。TVBNOW 含有熱門話題,最新最快電視,軟體,遊戲,電影,動漫及日常生活及興趣交流等資訊。# t$ {2 a0 T0 ^, M: G
華大基因市場部總監楊碧澄博士表示,今次研究與德國漢堡大學醫學院、中國疾控中心和軍事醫學科學院微生物流行病研究所聯合進行。漢堡是本次疫情的發源地,漢堡大學主要從事臨牀研究,中方則負責分析致病菌基因組。
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