在12×01《The Final Chapter: The Hope in the Horror》中，故事緊接上季結尾——Brennan被前任助理Zack Addy（Eric Millegan）綁架，
Booth和實驗室的其他成員想方設法尋找她。Zack遠程控制了所有的監控錄像，這給他們帶來了大麻煩。或
許Brennan仍然被Zack隱藏在傑斐遜學院內？無論如何，雖然他們最終救出了Brennan，但這只是更大危機的開始。
在12×02《The Brain in the Bot》中，一個人工智能機器人的製造者被人殺害，調查組懷疑他死於自己的人工智能機器人……
但這些機器人被編入了惡意程序。在12×03《The New Tricks in the Old Dogs》中，某酸性物質傾倒場中驚現一具老人屍體，
Booth、Brennan和實習助手們在調查中捲入了複雜的養老院糾紛。
Ed Asner將在終結季裡扮演Mike Mancuso，一個看起來很和藹，事實上很狡猾、很虛偽、很奸詐的兩面派，聰明過人。
Hal Holbrook將扮演海軍陸戰隊老兵Red Fletcher，沉默寡言但為人堅強……就像是40年後的Booth。
June Squibb扮演一個養老院的住戶，誰也招惹不起。
